A Chamada também criou a Rede Nacional de Pesquisa Clínica (RNPC), visando suporte a execução de projetos em fármacos, novos medicamentos, vacinas e bioequipamentos de interesse ao SUS. A RNPC é composta atualmente por 32 Hospitais Universitários e é coordenada pelo DECIT/MS (Departamento de Ciência e Tecnologia do Ministério da Saúde), sendo um fórum de debate permanente sobre pesquisa clínica no contexto do Sistema Único de Saúde.
A UPC passou a compor a Rede Nacional de Avaliação Tecnológica em Saúde (REBRATS), através de seleção do projeto de criação do NATS (Núcleo de Avaliação em Tecnologias de Saúde) do HCFMRP-USP, proposta submetida ao Edital DECIT/MS/ANVISA com apoio da OPAS/OMS e selecionada em julho de 2009. Os instrumentos principais para o embasamento das atividades dos NATS são avaliações da eficácia, efetividade, eficiência e segurança das intervenções de diagnóstico, prevenção e tratamento e criação de diretrizes terapêuticas baseadas em evidências visando o uso racional de tecnologias e a segurança do paciente.
A UPC tem apoiado a execução de projetos de interesse ao SUS com patrocínio do Ministério da Saúde em parceria com o CNPq e FINEP, através de ações coordenadas pelo DECIT. Além disso, mantém interação com a indústria farmacêutica nacional e transnacional, além de colaborações acadêmicas com outros centros de pesquisa clínica e com órgãos reguladores como a ANVISA, EMEA e FDA, resultando em troca de experiências, em pesquisa por membros de seu corpo de colaboradores e a constituição de base para o treinamento continuado em boas práticas de pesquisa.
Dessa forma, a UPC conta com profissionais qualificados com experiência na condução de ensaios clínicos multicêntricos e acadêmicos em diversas especialidades médicas para dar apoio ao desenvolvimento das pesquisas realizadas no âmbito do HCFMRP, a unidade disponibiliza treinamentos regulares em boas práticas clínicas e procedimentos dos protocolos e ainda conta com instalações adequadas como núcleo de coordenação e gerenciamento de projetos; farmácia de pesquisa clínica; laboratório de apoio para separação e armazenamento de material biológico; unidade de atendimento ambulatorial e internação para pesquisas de fase I a IV, biodisponibilidade e bioequivalência e equipamentos calibrados, que serão a seguir apresentados de forma detalhada.
A UPC é certificada junto a ANVISA para condução de estudos de biodisponibilidade e bioequivalência e pelo FDA e NIH para a realização de protocolos de pesquisa em colaboração. Em 2011 foi implantada uma unidade satélite da UPC para apoio na Unidade de Emergência (UE) do HCFMRP-USP. Atualmente a UPC tem como Coordenador Técnico Científico o Prof. Dr. Eduardo Barbosa Coelho.